Stagione 1

Il team cerca il rapitore di quattro donne.

Il team cerca un piromane che colpisce un campus.

Un emulo dinamitardo inizia a terrorizzare una comunità della Florida e Gideon è costretto a chiedere aiuto ad un vecchio nemico: un famoso terrorista rinchiuso in prigione per aver ucciso 6 agenti dell'FBI.

Il team al completo parte per la California del Sud, nel tentativo di fermare "Tommy the Killer" uno stupratore assassino seriale che si accanisce contro donne ricche incollando loro gli occhi aperti, in modo che non possano più chiuderli.

La figlia di un importante avvocato viene rapita e il suo ragazzo ucciso. Il team lavora sul profilo del rapitore, scoprendo che il soggetto ignoto è interessato anche alla sorella gemella in quanto convinto che siano innamorate di lui (Sindrome di De Clerambault). Quando diventa palese che S. I. conosce bene il modo di operare della squadra, Gideon decide di farlo uscire allo scoperto.

Il team di Gideon è chiamato a identificare un soggetto ignoto che colpisce a distanza, sparando alle vittime senza ucciderle e solo ad una certa ora del giorno. Tra i giornalisti si diffonde la voce che l'assassino potrebbe essere un poliziotto, ma poi si sospetta che l'uomo possa lavorare in ospedale e ferire le sue vittime per poi poterle salvare. Intanto, l'agente Spencer Reid, affronta l'ennesimo esame per impugnare una pistola e nell'azione successiva ha modo di utilizzarla.

L'Unità di Analisi Comportamentale lavora al caso di due famiglie trovate brutalmente assassinate. Il team scopre che l's.i. le rapisce e le tiene in ostaggio per giorni prima di ucciderle.

In una casa vengono trovati due corpi e viene sospettato un uomo visto sul luogo del delitto. Ma Gideon non è convinto e costruisce il profilo di un serial killer molto violento.

L'agente Ellen Greenaway si trova su un treno per il Texas quando un uomo paranoico e schizofrenico prende in ostaggio l'intero vagone chiedendo di parlare con una "entità superiore" e affermando di essere seguito e spiato dal Governo. Gideon e il suo team si precipitano sul luogo quando l'uomo chiede che gli venga rimosso qualcosa dal corpo, un chip da cui si sente eterodiretto. Nel telefilm le "voci" udite dall'uomo vengono impersonate da un attore.

L'unità di Analisi Comportamentale si trova ad indagare l'omicidio di un quarterback e sulla scomparsa della sua fidanzata cheerleader, facendo presumere che dietro all'evento ci sia una setta satanica. Ma Gideon non si fida ed inizia ad indagare sulla tranquilla città "perbene", le sue invidie, mobilitandone i cittadini alla ricerca della ragazza scomparsa per poterne osservare i comportamenti.

Hotchener insieme al team si reca presso un piccolo villaggio del sud alla ricerca di un killer con tendenze al cannibalismo. Gideon si è ferito ad una gamba e non può seguire direttamente il caso.

Una ragazzina viene rapita in un parco e l'unità di Analisi Comportamentale lotta contro il tempo per arrestare il rapitore che potrebbe ucciderla entro poche ore.

I clienti di un bar vengono ricoverati: si scopre in seguito che nel cibo sono state aggiunte abbondanti quantità di LSD, ma il team sospetta che quei clienti potrebbero essere soltanto un gruppo usato per esperimenti.

Due giorni prima dell'esecuzione di una coppia di assassini, Gideon si convince che la donna condannata potrebbe non aver ucciso il figlio, ma l'avrebbe solo protetto da suo marito.

Il vecchio mentore di Jason, Max Ryan, profiler in pensione, ha appena pubblicato un libro che parla di un serial killer che non è mai riuscito ad arrestare. Questo serial killer ha misteriosamente cessato di uccidere 20 anni fa, ma ricomincia in seguito alla pubblicazione del libro

Alcuni omicidi rituali avvenuti nel Nuovo Messico appaiono opera di un gruppo di Nativi Americani; tuttavia l'unità di Analisi Comportamentale raccoglie indizi che porterebbero ad un'altra pista, quella di una setta con intenzioni belliche, e con il progetto di scatenare una guerra interrazziale, come nel celebre caso di Charles Manson.

Un serial killer a Manhattan uccide persone che in passato hanno compiuto qualche reato, ma che alla fine sono state dichiarate "innocenti" dalla giuria; inducendo così la stampa a pensare che si tratti di un "protettore" che pratica la "giustizia della strada".

La squadra viene chiamata a Los Angeles per investigare su un S.I. che sembra puntare su un'attrice famosa, apparentemente uccidendo tutti i suoi concorrenti. A Reid viene dato il compito di sorvegliare l'attrice Lila Archer, da cui poi ne sarà attratto.

L'unità arriva in Messico per aiutare un capo della polizia che sta dando la caccia ad un locale assassino stupratore di signore anziane e deve convincere tutti che si tratta di un serial killer - una figura che non esiste nella cultura messicana.

La cattura di un assassino che tortura e affoga le sue vittime si rivela particolarmente difficile, poiché l'uomo sembra essere ricco, piacente e riesce continuamente a cambiare aspetto.

Gideon riceve l'ordine di portare tutto il suo team FBI presso il quartier generale della CIA per cercare una 'talpa' che ha ucciso un agente di alto livello e che potrebbe uccidere ancora.

I membri del team, pur essendo in vacanza, quasi per gioco vengono spinti alla ricerca di alcuni indizi e attirati all'interno di un elaborato gioco organizzato e controllato da una figura piuttosto misteriosa.